Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM27P14373 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM27P14373 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM27P14373 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM27P14373 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM27P14373 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM27P14373 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM27P14373 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM27P14373 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms