Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms