Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPBP07199 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPBP07199 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBP07199 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms