Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms