Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL18O94889 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms