Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL13O43927 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL13O43927 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL13O43927 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms