Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PLXNB1O43157 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms