Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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