Protein–RNA interactions for Protein: O00623

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX12O00623 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX12O00623 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX12O00623 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX12O00623 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX12O00623 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX12O00623 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX12O00623 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX12O00623 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX12O00623 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX12O00623 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX12O00623 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX12O00623 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PEX12O00623 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms