Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms