Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms