Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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