Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms