Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms