Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1L2Q9P2F8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms