Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms