Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms