Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms