Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms