Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms