Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms