Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms