Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms