Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms