Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms