Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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CNIH3Q8TBE1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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CNIH3Q8TBE1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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