Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms