Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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