Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLD3Q8IV08 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms