Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms