Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms