Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM164Q5U3C3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM164Q5U3C3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms