Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms