Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms