Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms