Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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