Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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GRIK5Q16478 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GRIK5Q16478 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GRIK5Q16478 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GRIK5Q16478 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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