Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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