Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA4Q13439 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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