Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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