Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHAF1AQ13111 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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