Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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TRAF1Q13077 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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TRAF1Q13077 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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TRAF1Q13077 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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TRAF1Q13077 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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