Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EP300Q09472 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EP300Q09472 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EP300Q09472 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EP300Q09472 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms