Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms