Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms