Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms