Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms