Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms