Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms