Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NESP48681 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NESP48681 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NESP48681 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NESP48681 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NESP48681 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NESP48681 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NESP48681 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NESP48681 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NESP48681 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms